bioinformatikker

Arbeidsoppgaver

Etablere nødvendig infrastruktur og validerte arbeidsflyter for store genpanel analyser ved Stavanger universitetssjukehusEtablere analyseplattformen for store NGS-baserte genpaneler.Utvikle og validere bioinformatiske analysepipelines.Sikre at analysene kan brukes i rutinediagnostikk ved sykehusetAnsvarlig for god kontakt og samarbeid med Helse Vest IKTImplementere verktøy som GATK, BWA, SAMtools, FastQC, Nextflow eller Snakemake.Arbeide med Linux-miljøer, Docker/Singularity og versjonskontroll (Git). Behandle og kvalitetskontrollere NGS-data fra kreftpasienter.Identifisere mutasjoner, kopitallsendringer, fusjoner og andre klinisk relevante genomiske funn.Bidra til klinisk tolkning av resultatene sammen med patologer og molekylærbiologer.Bygge lokal kompetanse innen genomisk diagnostikk og bioinformatikk.Samarbeide med ansatte ved molekylærpatologien for å innføre nye analyser og arbeidsmetoder. Gjøre det mulig å identifisere pasienter som kan inkluderes i presisjonsmedisinske studier.Bidra til InPreD-samarbeidet og nasjonale forskningsprosjekter.Øke rekruttering av pasienter til kliniske studier gjennom bedre molekylær diagnostikk. Generere og analysere genomiske data til forskningsprosjekter.Samarbeide med forskere innen kreftgenomikk og presisjonsmedisin.Potensielt bidra til vitenskapelige publikasjoner og metodeutvikling

Kvalifikasjoner

Master eller doktorgrad innen molekylærbiologi eller bioinformatikk. Master/dr. grad innen tilsvarende felter kan vurderesErfaring med verktøy og pipelines for handtering og analyse av NGS-data (t.d. GATK, FastQC, BWA, SAM tools) er nødvendig.Erfaring med programmeringsspråk (Python, R, C++, bash), teknologier (t.d. kubernetes, git, Docker/Singularity Containers), metodologier (t.d. gitops, devops, tdd) og/eller oppsett og drift av linuxbaserte OSErfaring innen genomikk drevene basale eller kliniske kreft studier anses som en fordel.Kjennskap til Workflow Management Systems som Nextflow eller Snakemake er en fordelKjennskap til/erfaring med Illumina NGS-instrumenter og tilhørende analysetjenester (LocalApp, Dragen) og/eller TSO500-panelet er en fordelKjennskap til skybaserte tjenester analyse (cloud computing/analysis) eller høyytelsesberegninger (HPC) er en fordelErfaring eller kjennskap til arbeid i sykehusmiljø eller kliniske laboratorier vil være en fordelVi setter pris på deg som ta selv initiativBeherske norsk muntlig og skriftlig. Søkere som har annet morsmål enn norsk, svensk eller dansk, og som ikke har fullført norskspråklig videregående skole, må minimum ha bestått Bergenstesten, eller annen norsk test på B2 nivå. Dokumentasjon må vedlegges søknaden. Ved ansettelse av allerede fast ansatt i foretaket kan en unntaksvis, i særlige tilfeller, fravike kravet om bestått norsktest på B2-nivå.

Personlige egenskaper

Vi søker en person som er resultatorientert, strukturert og har evne til å jobbe selvstendig.I tillegg til å være arbeidsom stilles det høye krav til nøyaktighet.Du bidrar positivt til et faglig og kollegialt godt miljøDu er god til å se hva som må gjøres, og tilbyr og mottar gjerne hjelp.Det er også ønskelig at kandidaten jobber ryddig, er pliktoppfyllende og har god kommunikasjonsevne.

Vi tilbyr

Trivelig arbeidsmiljøLønn i samsvar med gjeldende overenskomstHjem-jobb-Hjem-avtale (god rabatt på 30 dagers billett samt gratis bruk av bysykkel)Gode pensjons- og forsikringsordningerGode velferdsordninger

Vi oppfordrer alle søkere til å benytte Vitnemålsportalen for å laste opp verifiserte vitnemål og karakterutskrifter, der det er mulig. Har du utdanning fra utlandet, legg ved godkjenning fra Direktoratet for høyere utdanning og kompetanse.

Mangfoldserklæring

Foretaksgruppen i Helse Vest ønsker å gjenspeile mangfoldet i befolkningen i vår rekruttering. Vi oppfordrer alle som er kvalifiserte til å søke ledige stillinger uansett kjønn, alder, funksjonsevne og flerkulturell bakgrunn. Det samme gjelder dersom man har hatt et lengre opphold fra arbeidslivet. Foretaksgruppen Helse Vest ønsker å legge til rette for et inkluderende rekruttering.

Kontaktinformasjon

Emilius Janssen, Seksjonsleder, 95890963

Arbeidssted

Sykehusveien 804021 Stavanger

Nøkkelinformasjon

Arbeidsgiver: Helse Stavanger HFReferansenr.: [phone]Stillingsprosent: 100%EngasjementStartdato: 01.12.2026Sluttdato: 31.05.2028Søknadsfrist: 27.10.2026